No estar bajo tratamiento con antibióticos o antimicóticos una semana antes de la toma de la muestra, en caso de ya estar en tratamiento se realizará el estudio baja autorización del médico tratante. No aplicarse pomadas, cremas o soluciones antisépticas, talcos, etc. Mínimo 3 días antes de la toma de muestra de la lesión.
En el caso de muestras de tracto respiratorio superior, tener un ayuno de horas y sin aseo bucal. En muestras de biopsias y tejidos colocar la muestra en un frasco estéril con solución salina estéril. En muestras óticas o conjuntivales no aplicarse tópicos (cremas o ungüentos) 2 días antes del examen.