Se debe recolectar muestra de materia fecal en un recipiente de plástico estéril, evitar contaminar la muestra con orina, agua, crema, talco o sustancias desinfectantes. Entregue la muestra en el laboratorio en el menor tiempo posible. Las muestras diarreicas o líquidas deben ser entregadas lo más pronto posible al laboratorio clínico, antes de 1 hora. Si el paciente es un bebé y tiene diarrea, apenas se cambie el pañal, se debe recoger de inmediato para evitar que el pañal lo absorba.