Para la realización del examen debe recolectar muestra de materia fecal en un recipiente de plástico, estéril y de boca ancha, (el llenado debe ser hasta las ¾ partes del recipiente). Evite contaminar la muestra con orina, agua, crema, talco o sustancias desinfectantes. Las muestras diarreicas o líquidas deben ser entregadas lo más pronto posible al laboratorio clínico, antes de 1 hora. Cuando se trata de lactantes, no es conveniente obtener la muestra del pañal, por lo que se recomienda poner el pañal desechable al revés para evitar la deshidratación de la muestra.